Vraag:
Zoeken naar genexpressiegegevens per cellijn
JSneathThompson
2017-06-16 16:42:57 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Ik heb twee kankercellijnen (OCI-Ly18 & riva) waarvoor ik genexpressiegegevens wil vinden, maar ik ben niet op de hoogte van veel genexpressiedatabases die zoeken op cellijn mogelijk maken zonder te zoeken op gen.

Ik heb Genevestigator geprobeerd op aanbeveling van deze thread, maar vond geen gegevens op geen van beide cellijnen.

Wat zou het beste zijn manier om genexpressiegegevens voor deze cellijnen te vinden?

Twee antwoorden:
Kristoffer Vitting-Seerup
2017-06-16 16:59:38 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Probeer de Gene Expression Omnibus - het lijkt erop dat ze enkele datasets hebben.

@JSneathThompson Overweeg om het antwoord als geaccepteerd te markeren als dit de best werkende oplossing voor u lijkt.
plat
2017-06-16 17:30:33 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Probeer in dit gedeelte van de Cancer Cell Line Encyclopedia. Het heeft expressiegegevens voor veel kankercellijnen. Ik heb het een paar keer geprobeerd en alle cellijnen gevonden die ik wilde, behalve HeLa. U hoeft alleen maar mRNA-expressiegegevens te selecteren en het gewenste bestand te downloaden (onbewerkte gegevens, gencentrisch, enz.)



ⓘ
Deze Q&A is automatisch vertaald vanuit de Engelse taal.De originele inhoud is beschikbaar op stackexchange, waarvoor we bedanken voor de cc by-sa 3.0-licentie waaronder het wordt gedistribueerd.
Loading...