Vraag:
Human Cell Atlas - Beschikbaarheid van gegevens
Gregor Sturm
2018-02-14 17:16:36 UTC
view on stackexchange narkive permalink

In een nieuwsbericht van 18-10-2017 op de website van de Human Cell Atlas staat:

Daarnaast heeft het consortium vandaag ook de aanstaande release aangekondigd van genexpressieprofielen van de eerste miljoen immuuncellen verzameld onder de HCA, naar een eerste mijlpaal van het verzamelen van ten minste 30 miljoen cellen die verschillende weefsels en organen vertegenwoordigen voor de eerste versie van de atlas. Deze gegevens, die begin november in een online opslagplaats worden geplaatst, zullen gratis beschikbaar zijn voor gebruik door onderzoekers . ( https://www.humancellatlas.org/news/14)

Vanaf nu, februari 2018, kan ik deze gegevens nergens meer vinden. Weet iemand waar ik de genexpressiegegevens van deze 1 miljoen immuuncellen kan downloaden of wanneer deze uiteindelijk gepubliceerd zullen worden?

De preview-versie is [nu hier beschikbaar] (https://preview.data.humancellatlas.org/)
Een antwoord:
burger
2018-02-23 22:10:29 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Er is nu een bericht op Biostars:

We beginnen met het definiëren van het releaseproces voor de Human Cell Atlas.

De De eerste paar HCA-releases zullen voornamelijk eencellige RNA-Seq zijn en we zijn benieuwd wat u van onze releases verwacht.

Vul onze enquête in als u ons wilt helpen onze releases te definiëren

https://www.surveymonkey.com/r/S6Y753P

En ik veronderstel dat dat de oorspronkelijke vraag beantwoordt: de gegevens hebben is nog niet uitgebracht en zal dat waarschijnlijk voorlopig niet zijn, aangezien ze nog steeds bespreken hoe ze het beschikbaar kunnen maken.

Update (van hetzelfde bericht):

De eerste productierelease van de DCP vindt plaats in juni.

De eerste dataversie van HCA richt zich op Q4 2018.



Deze Q&A is automatisch vertaald vanuit de Engelse taal.De originele inhoud is beschikbaar op stackexchange, waarvoor we bedanken voor de cc by-sa 3.0-licentie waaronder het wordt gedistribueerd.
Loading...