Vraag:
Komt het DNA of RNA van sommige etnische groepen beter overeen met de menselijke referentiegenoomsequentie dan die van andere?
charlesdarwin
2018-03-04 06:43:01 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Ik geloof dat de referentie van het menselijk genoom DNA-monsters van verschillende mensen heeft genomen en dat er in extra contigs enige natuurlijke variatie is opgenomen.

Het menselijke referentiegenoom is echter afkomstig van een beperkt aantal mensen.

Kunnen het beperkte aantal donoren en de lineaire weergave van het genoom (in tegenstelling tot een grafische weergave die mogelijk variatie omvat) een analyse beïnvloeden ten gunste van de ene etnische groep boven de andere? Zijn er onderzoeken die de afstemmingspercentages / kaartmogelijkheden van leesbewerkingen van mensen uit verschillende geografische regio's hebben vergeleken? Komen de teksten van sommige etnische groepen beter overeen met de referentie?

Een antwoord:
benn
2018-03-04 14:12:36 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Voor eenvoudige varianten zoals SNP's zou het niet echt een probleem zijn om de huidige genoomassemblage te gebruiken voor andere etnische groepen. Maar voor complexere varianten kan dit inderdaad problematisch zijn, echter niet alleen voor etnische groepen maar ook voor individuen binnen dezelfde populatie. Denk aan zeer complexe regio's zoals HLA of KIR.

In onderzoeken waarin ze verschillende etnische groepen vergelijken (bijv. 1000 G) bespreken ze dergelijke zaken liever niet, maar doen ze alsof de analyse 100% perfect is.

Er is een leuke opmerking in Genome Biology over dit probleem.



Deze Q&A is automatisch vertaald vanuit de Engelse taal.De originele inhoud is beschikbaar op stackexchange, waarvoor we bedanken voor de cc by-sa 3.0-licentie waaronder het wordt gedistribueerd.
Loading...